DOI - Vydavatelství Mendelovy univerzity v Brně

Identifikátory DOI

ISBN online: 978-80-7701-016-0 | DOI: 10.11118/978-80-7701-016-0

Metodika hodnocení diverzity jednonukleotidových polymorfismů (SNP) v kandidátních genech rezistence vůči infekčním onemocněním u včely medonosné

CERTIFIKOVANÁ METODIKA č. QK22020324_CM2

Aleš Knoll, Martin Šotek, Petra Bartoňová, Antonín Přidal, Tomáš Urban

Certifikovaná metodika obsahuje detailní popis laboratorní analýzy založené na molekulárně genetickém přístupu využívajícím panel jednonukleotidových polymorfizmů (SNP) u genů kandidátních pro rezistenci a imunitní odpověď za účelem vyhodnocení genetické variability v těchto genech včely medonosné v České republice. Byl sestaven panel 13 validních, polymorfních lokusů vhodných pro rutinní testování metodou sekvenování za primerem, tzv. SNaPshot, která je spojena fluorescenční kapilární elektroforézou a amplifikací genů pomocí multiplexní polymerázové řetězové reakce (PCR).

Klíčová slova: Metodika, diverzita, SNP, včela medonosná, infekční onemocnění

1. vydání, online: 2024, vydavatel: Mendelova univerzita v Brně



Reference

  1. BROECKX, Bart J. G. et al. 2019. Honey bee predisposition of resistance to ubiquitous mite infestations. Scientific Reports. 9(1), 1-11. ISSN 2045-2322. https://doi.org/10.1038/s41598-019-44254-8 Přejít k původnímu zdroji...
  2. BRUTSCHER, Laura M; DAUGHENBAUGH, Katie F; FLENNIKEN, Michelle L. 2015. Antiviral defense mechanisms in honey bees. Current Opinion in Insect Science. 10, 71-82. ISSN 22145745. https://doi.org/10.1016/j.cois.2015.04.016 Přejít k původnímu zdroji...
  3. CONLON, Benjamin H. et al. 2019. A gene for resistance to the Varroa mite (Acari) in honey bee (Apis mellifera) pupae. Molecular Ecology. 28(12), 2958-2966. ISSN 0962-1083. https://doi.org/10.1111/mec.15080 Přejít k původnímu zdroji...
  4. GALBRAITH, David A. et al. 2015. Parallel Epigenomic and Transcriptomic Responses to Viral Infection in Honey Bees (Apis mellifera). PLOS Pathogens. 11(3). ISSN 1553-7374. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1004713 Přejít k původnímu zdroji...
  5. HADDAD, Nizar et al. 2016. Next generation sequencing of Apis mellifera syriaca identifies genes for Varroa resistance and beneficial bee keeping traits. Insect Science. 23(4), 579-590. ISSN 1672-9609. https://doi.org/10.1111/1744-7917.12205 Přejít k původnímu zdroji...
  6. HARBO, John R; HARRIS, Jeffrey W. 2005. Suppressed mite reproduction explained by the behaviour of adult bees. Journal of Apicultural Research. 44(1), 21-23. ISSN 0021-8839. https://doi.org/10.1080/00218839.2005.11101141 Přejít k původnímu zdroji...
  7. HARBO, John R.; HARRIS, Jeffrey W. 2008. Responses to Varroa by honey bees with different levels of Varroa Sensitive Hygiene. Journal of Apicultural Research. 48(3), 156-161. ISSN 0021-8839. https://doi.org/10.3896/IBRA.1.48.3.02 Přejít k původnímu zdroji...
  8. HENRIQUES, Dora et al. 2021. A SNP assay for assessing diversity in immune genes in the honey bee (Apis mellifera L.). Scientific Reports. 11(1), 1-12. ISSN 2045-2322. https://doi.org/10.1038/s41598-021-94833-x Přejít k původnímu zdroji...
  9. KENCE, Meral et al. 2013. Honey bee colonies from different races show variation in defenses against the varroa mite in a 'common garden'. Entomologia Experimentalis et Applicata. 149(1), 36-43. ISSN 0013-8703. https://doi.org/10.1111/eea.12109 Přejít k původnímu zdroji...
  10. KIM, Jong Seok et al. 2019. Single-nucleotide polymorphism markers in mitochondrial genomes for identifying Varroa destructor -resistant and -susceptible strains of Apis mellifera (Hymenoptera: Apidae). Mitochondrial DNA Part A. 30(3), 477-489. ISSN 2470-1394. https://doi.org/10.1080/24701394.2018.1551385 Přejít k původnímu zdroji...
  11. KNOLL, Aleš et al. 2024. Haplotype Diversity in mtDNA of Honeybee in the Czech Republic Confirms Complete Replacement of Autochthonous Population with the C Lineage. Insects. 15(7). ISSN 2075-4450. https://doi.org/10.3390/insects15070495 Přejít k původnímu zdroji...
  12. LARSEN, Alejandra; REYNALDI, Francisco José; GUZMÁN-NOVOA, Ernesto. 2019. Fundaments of the honey bee (Apis mellifera) immune system. Review. Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias. 10(3), 705-728. ISSN 2448-6698. https://doi.org/10.22319/rmcp.v10i3.4785 Přejít k původnímu zdroji...
  13. LE CONTE, Y. et al. 2011. Social immunity in honeybees (Apis mellifera): transcriptome analysis of varroa-hygienic behaviour. Insect Molecular Biology. 20(3), 399-408. ISSN 09621075. https://doi.org/10.1111/j.1365-2583.2011.01074.x Přejít k původnímu zdroji...
  14. LEFEBRE, Regis et al. 2024. Allele Frequencies of Genetic Variants Associated with Varroa Drone Brood Resistance (DBR) in Apis mellifera Subspecies across the European Continent. Insects. 15(6). ISSN 2075-4450. https://doi.org/10.3390/insects15060419 Přejít k původnímu zdroji...
  15. LEFEBRE, Regis et al. 2024. Population-wide modelling reveals prospects of marker-assisted selection for parasitic mite resistance in honey bees. Scientific Reports. 14(1). ISSN 2045-2322. https://doi.org/10.1038/s41598-024-58596-5 Přejít k původnímu zdroji...
  16. LIU, Y. et al. 2016. Larva-mediated chalkbrood resistance-associated single nucleotide polymorphism markers in the honey bee A pis mellifera. Insect Molecular Biology. 25(3), 239-250. ISSN 0962-1075. https://doi.org/10.1111/imb.12216 Přejít k původnímu zdroji...
  17. LOCKE, Barbara et al. 2012. Host adaptations reduce the reproductive success of Varroa destructor in two distinct European honey bee populations. Ecology and Evolution. 2(6), 1144-1150. ISSN 2045-7758. https://doi.org/10.1002/ece3.248 Přejít k původnímu zdroji...
  18. MCMENAMIN, Alexander et al. 2018. Honey Bee and Bumble Bee Antiviral Defense. Viruses. 10(8), 395-416. ISSN 1999-4915. https://doi.org/10.3390/v10080395 Přejít k původnímu zdroji...
  19. MONDET, Fanny et al. 2015. Antennae hold a key to Varroa-sensitive hygiene behaviour in honey bees. Scientific Reports. 5(1), 5-16. ISSN 2045-2322. https://doi.org/10.1038/srep10454 Přejít k původnímu zdroji...
  20. MONDET, Fanny et al. 2020. Honey bee survival mechanisms against the parasite Varroa destructor: a systematic review of phenotypic and genomic research efforts. International Journal for Parasitology. 50(6-7), 433-447. ISSN 00207519. https://doi.org/10.1016/j.ijpara.2020.03.005 Přejít k původnímu zdroji...
  21. NAVAJAS, M et al. 2008. Differential gene expression of the honey bee Apis mellifera associated with Varroa destructor infection. BMC Genomics. 9(1), 1-11. ISSN 1471-2164. https://doi.org/10.1186/1471-2164-9-301 Přejít k původnímu zdroji...
  22. NEGRI, Pedro et al. 2016. Cellular immunity in Apis mellifera: studying hemocytes brings light about bees skills to confront threats. Apidologie. 47(3), 379-388. ISSN 0044-8435. https://doi.org/10.1007/s13592-015-0418-2 Přejít k původnímu zdroji...
  23. SCHÖNING, Caspar et al. 2012. Evidence for damage-dependent hygienic behaviour towards Varroa destructor-parasitised brood in the western honey bee, Apis mellifera. Journal of Experimental Biology. 215(2), 264-271. ISSN 1477-9145. https://doi.org/10.1242/jeb.062562 Přejít k původnímu zdroji...
  24. SEPEHRI Bita et al. 2023. Molecular Screening of Varroa-Resistant Trait of Honey Bee Colonies based on NorpA2 Candidate Gene Polymorphism: A Genetic Case-Control Study. Iranian Journal of Applied Animal Science. 13(1):177-185. ISSN 2251631X.
  25. SPÖTTER, Andreas et al. 2016. Genome-Wide Association Study of a Varroa-Specific Defense Behavior in Honeybees (Apis mellifera). Journal of Heredity. 107(3), 220-227. ISSN 0022-1503. https://doi.org/10.1093/jhered/esw005 Přejít k původnímu zdroji...
  26. RAMSEY, Samuel D. et al. 2019. Varroa destructor feeds primarily on honey bee fat body tissue and not hemolymph. Proceedings of the National Academy of Sciences. 116(5), 1792-1801. ISSN 0027-8424. https://doi.org/10.1073/pnas.1818371116 Přejít k původnímu zdroji...
  27. TEIXEIRA, Érica Weinstein et al. 2021. Transcriptomic analysis suggests candidate genes for hygienic behavior in African-derived Apis mellifera honeybees. Apidologie. 52(2), 447-462. ISSN 0044-8435. https://doi.org/10.1007/s13592-020-00834-6 Přejít k původnímu zdroji...
  28. TSURUDA, Jennifer M. et al. 2012. High-Resolution Linkage Analyses to Identify Genes That Influence Varroa Sensitive Hygiene Behavior in Honey Bees. PLoS ONE. 7(11), 1-8. ISSN 1932-6203. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0048276 Přejít k původnímu zdroji...
  29. YANG, Xiaolong,; COX-FOSTER, Diana L; RBERENBAUM, May R. 2005. Impact of an Ectoparasite on the Immunity and Pathology of an Invertebrate: Evidence for Host Immunosuppression and Viral Amplification. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102(21), 7470-7475. ISSN 00278424. https://doi.org/10.1073/pnas.0501860102 Přejít k původnímu zdroji...