DOI - Vydavatelství Mendelovy univerzity v Brně

Identifikátory DOI

ISBN online: 978-80-7701-014-6 | DOI: 10.11118/978-80-7701-014-6

MORAVSKÝ KRAS POD MIKROSKOPEM

Kritický Katalog Výstavy

Ivo Pavlík, Vít Ulmann, Vlastislav Káňa

Přírodovědný výzkum Moravského krasu zahrnuje mnoho oborů, kterými jsou geologie, zoologie a botanika, ekologie a další. V posledních 10 letech byla pozornost zaměřena na mikrobiologické a především bakteriologické studium vody a sedimentů, na prostředí lesů, luk a především na studium jeskynního prostředí. Úloha bakterií v systému člověkem více i méně ovlivněné krasové přírody byla v Moravském krasu dosud známa jen obecně. Život těchto mikroskopických organismů zůstával zejména v jeskynním prostředí zčásti nepoznaný. Výzkumný tým vedený profesorem Ivo Pavlíkem, složený z odborníků Mendelovy univerzity v Brně, Zdravotního ústavu se sídlem v Ostravě, Muzea Blanenska a dalších institucí, se rozhodl tuto mezeru zaplnit. Za indikátorový mikroorganismus si vybrali mykobakterii. Také výzkum dalších drobných obyvatel krasové krajiny se bez mikroskopu nebo aspoň lupy neobejde. Třeba drobné kostičky netopýrů a dalších savců jsou svědectvím o změnách klimatu a krajiny v minulosti. Vrstvičky netopýřího guána, nánosy říčních sedimentů v podzemí, nebo žížaly v něm žijící; to všechno jsou pro nás zdroje poznání mechanismu, jakým příroda Moravského krasu funguje. I vy si můžete nyní vyzkoušet, jaké to je ponořit se prostřednictvím okuláru mikroskopu a různých moderních laboratorních metod do světa těch opravdu malých organismů, které tak významně ovlivňují život přírody v Moravském krasu a v některých případech i ten náš.

Klíčová slova: karst caves, speleology, cave diving, ecology, archaeology, palaeontology, root stalagmites, radiocarbon dating, chiropterology, bacteriology, microbiology, mycology, water sediment, demography, suburbanization, geography, hydrology, dripping water, alluvial water, phreatic water, pollution of the karst environment, wastewater treatment plant, water biofilm, epidemiology, Mycobacterium, tuberculosis, mycobacteriosis, nontuberculous mycobacteria, indicatory bacteria; psychrophilic mycobacteria; mesophilic mycobacteria, thermophilic mycobacteria, diagnosis of mycobacterial infections, light microscopy, electron microscopy, DNA, qPCR, MALDI, computed tomography, X-ray examination, bat, guano, invertebrate animals, earthworms, earthworms castings, dust, GIS, food safety, infection prevention, BCG vaccination, speleotherapy

1. vydání, online: 2024, vydavatel: Mendelova univerzita v Brně



Reference

  1. ABSOLON, K. 1970a. Moravský kras 1. Academia, Praha, 1970a, 415 s.
  2. Absolon, K. 1970b Moravský kras 2. Academia, Praha, 1970b, 345 s.
  3. Abudaff, N. N., Beam, E. 2017. Mycobacterium arupense: A review article on an emerging potential pathogen in the Mycobacterium terrae complex. Journal of Clinical Tuberculosis and Other Mycobacterial Diseases. 22(10), 1-5. Přejít k původnímu zdroji...
  4. Anděra, M. 2019. Naši netopýři. 2. vyd. Průhonice: Správa jeskyní České republiky. 168 s. ISBN, 978-80-87309-22-3
  5. Audyová, J. 1993. Moravský kras: čas a kámen. 1. vyd. Boskovice. 144 s. ISBN 80-901260-7-3
  6. Ayele, W. Y., Machackova, M., Pavlik, I. 2001. The transmission and impact of paratuberculosis infection in domestic and wild ruminants. Veterinarni Medicina. 46(7-8), 205-224. Přejít k původnímu zdroji...
  7. Beran, V., Havelkova, M., Kaustova, J., Dvorska, L., Pavlik, I. 2006. Cell wall deficient forms of mycobacteria: A review. Veterinarni Medicina. 51(7), 365-389. Přejít k původnímu zdroji...
  8. Bezplatný kartografický-GIS nástroj: QGIS.
  9. Bilej, M., De Baetselier, P., Beschin, A. 2000. Antimicrobial defense of the earthworm. Folia Microbiologica Praha. 45, 283-300. Přejít k původnímu zdroji...
  10. Blahutkova, M., Fictum, P., Skoric, M., Bezdekova, B., Jahn, P., Kriz, P., Mrlik, V., Slana, I., Kaevska, M., Pavlik, I. 2011. Mycobacterium avium subsp. hominissuis infection in two sibling Fjord horses diagnosed by quantitative real time PCR: A case report. Veterinarni Medicina. 56(6), 294-301. Přejít k původnímu zdroji...
  11. Boček, A. 1922. Moravský Kras Průvodce celým jeho územím a jeho krápníkovými jeskyněmi. Praha: Körber. 156 s.
  12. D'Ambrosio, L., Centis, R., Sotgiu, G., Pontali, E., Spanevello, A., Migliori, G.B. 2015. New anti-tuberculosis drugs and regimens, 2015 update. ERJ Open Research. (1), 00010-2015. Přejít k původnímu zdroji...
  13. Demain, A. L., Martens, E. 2017. Production of valuable compounds by molds and yeasts. Online. The Journal of Antibiotics. 70(4), 347-360. Přejít k původnímu zdroji...
  14. Djelouadji, Z., Raoult, D., Drancourt, M. 2011. Palaeogenomics of Mycobacterium tuberculosis: Epidemic bursts with adegrading genome. Lancet. Infectious Diseases. 11(8), 641-650. Přejít k původnímu zdroji...
  15. Dražan, J., Cupák, M., Černý, L., Dobeš, M., Jedlička, J., Kábrt, J., Klimeš, B., Klobouk, A., Kouba, V., Kubík, A., Mikotová, E., Pavlas, M., Pivník, L., Pravda, D., Rejthar, E., Rossi, L., Ryšánek, M., Říha, V., Štěpánek, M., Zendulka M. 1962. Tuberkulóza hospodářských zvířat. 1. vyd. Praha: Státní zemědělské nakladatelství. 509 s.
  16. Dulberger, C. L., Rubin, E. J., Boutte, C. C. 2020. The mycobacterial cell envelope - a moving target. Nature Reviews Microbiology. 18(1), 47-59. Přejít k původnímu zdroji...
  17. Dvorska, L., Bartos, M., Ostadal, O., Kaustova, J., Matlova, L., Pavlik, I. 2002. IS1311 and IS1245 restriction fragment length polymorphism analyses, serotypes, and drug susceptibilities of Mycobacterium avium complex isolates obtained from a human immunodeficiency virus-negative patient. Journal of Clinical Microbiology. 40(10), 3712-3719. Přejít k původnímu zdroji...
  18. Dvorska, L., Matlova, L., Ayele, W. Y., Fischer, O. A., Amemori, T., Weston, R. T., Alvarez, J., Beran, V., Moravkova, M., Pavlik, I. 2007. Avian tuberculosis in naturally infected captive water birds of the Ardeidae and Threskiornithidae families studied by serotyping, IS901 RFLP typing and virulence for poultry. Veterinary Microbiology. 119, 366-374. Přejít k původnímu zdroji...
  19. EFSA. 2023. The European Union One Health 2022 Zoonoses Report. EFSA Journal. 21(12), e8442. Přejít k původnímu zdroji...
  20. El-Gendi, H., Saleh, A. K., Badierah, R., Redwan, E.M., El-Maradny, Y. A., El-Fakharany, E. M. 2021 A comprehensive insight into fungal enzymes: Structure, classification, and their role in mankind's challenges. Journal of Fungi. 8(1), 23. Přejít k původnímu zdroji...
  21. Eurostat. 2020. Tuberculosis - Annual Epidemiological Report for 2020. Eurostat. (europa.eu)
  22. Fischer, O., Matlova, L., Bartl, J., Dvorska, L., Melicharek, I., Pavlik, I. 2000. Findings of mycobacteria in insectivores and small rodents. Folia Microbiologica. 45(2), 147-152. Přejít k původnímu zdroji...
  23. Fischer, O., Matlova, L., Dvorska, L., Svastova, P., Bartl, J., Melicharek, I., Weston, R. T., Pavlik, I. 2001. Diptera as vectors of mycobacterial infections in cattle and pigs. Medical and Veterinary Entomology. 15(2), 208-211. Přejít k původnímu zdroji...
  24. Fischer, O. A., Matlova, L., Bartl, J., Dvorska, L., Svastova, P., Du Maine, R., Melicharek, I., Bartos, M., Pavlik, I. 2003a. Earthworms (Oligochaeta, Lumbricidae) and mycobacteria. Veterinary Microbiology. 91 (4), 325-338. Přejít k původnímu zdroji...
  25. Fischer, O. A., Matlova, L., Dvorska, L., Svastova, P., Pavlik, I. 2003b. Nymphs of the Oriental cockroach, Blatta orientalis as passive vectors of causal agents of avian tuberculosis and paratuberculosis. Medical and Veterinary Entomology. 17(2), 145-150. Přejít k původnímu zdroji...
  26. Fischer, O. A., Matlova, L., Dvorska, L., Svastova, P., Bartl, J., Weston, R. T., Pavlik, I. 2004a. Blowflies Calliphora vicina and Lucilia sericata as passive vectors of Mycobacterium avium subsp. avium, M. a. paratuberculosis and M. a. hominissuis. Medical and Veterinary Entomology. 18(2), 116-122. Přejít k původnímu zdroji...
  27. Fischer, O. A., Matlova, L., Dvorska, L., Svastova, P., Peral, D. L., Weston, R. T., Bartos, M., Pavlik, I. 2004b. Beetles as possible vectors of infections caused by Mycobacterium avium species. Veterinary Microbiology. 102, 247-255. Přejít k původnímu zdroji...
  28. Fischer, O. A., Matlova, L., Dvorska, L., Svastova, P., Bartos, M., Weston, R.T., Kopecna, M., Trcka, I., Pavlik, I. 2005. Potential risk of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis spread by syrphid flies in infected cattle farms. Medical and Veterinary Entomology. 19, 360-366. Přejít k původnímu zdroji...
  29. Fischer, O. A., Matlova, L., Dvorska, L., Svastova, P., Bartos, M., Weston, R.T., Pavlik, I. 2006. Various stages in the life cycle of syrphid flies (Eristalis tenax; Diptera: Syrphidae) as potential mechanical vectors of pathogens causing mycobacterial infections in pig herds. Folia Microbiologica. 51(2), 147-153. Přejít k původnímu zdroji...
  30. Fremrová, L., Ulmann, V., Pavlík, I. 2022. Jakost vod - Stanovení atypických mykobakterií ve vodě. Česká technická norma (ČSN) 75 7840. Česká agentura pro standardizaci (ČAS). 24 s.
  31. Fremrová, L., Ulmann, V., Pavlík, I. 2023. Stanovení mykobakterií v pevných matricích. Česká technická norma (ČSN) 83 8181. Česká agentura pro standardizaci (ČAS). 28 s.
  32. Geršl, M., Koutecký, B., Pavlík, I. 2017. Speleology as adrenalin phenomenon and current security risks. In: Sborník z konference Rekreace a ochrana přírody (RaOP 2017). 1. - 3. května 2017, Brno, p. 365-370. ISBN 978-80-7509-488-9.
  33. Grange, J. M. 1996. Mycobacteria and human disease. 2. vyd. London: Arnold; New York: Oxford University Press. 250 s. ISBN 0340645636
  34. Grym, M., Grymová, V., Halouzka, R., Trčka, I., Bartoš, M., Těšínská, I., Horváthová, A., Svobodová, J., Pavlík, I. 2006. Primární adenokarcinom plic klinicky napodobující tuberkulózu u kočky. Veterinářství. 56(5), 277-285. Přejít k původnímu zdroji...
  35. Hazen, R. M. 2015. Příběh Země. Academia. 300 s., ISBN 978-80-200-2401-5.
  36. Hricíková, I., Šterclová, M., Vašáková. M. 2011. Netuberkulózní mykobakteriózy. Praktický lékař. 91(3), 144-147.
  37. Hromas, J. (ed.). 2009. Jeskyně. In: Mackovič, P., Sedláček, M. (eds.) Chráněná území ČR. Svazek XIV. Praha (Agentura ochrany přírody a krajiny ČR). 608 s. ISBN 978-80-87051-17-7
  38. Hübelová, D., Pavlík, I. 2016. Vývoj počtu obyvatelstva a technické infrastruktury v obcích Moravského krasu: potenciální vliv na organické znečištění vodního prostředí. Geografické informácie. (20)2, 468-484. ISSN 1337-9453 Přejít k původnímu zdroji...
  39. Hübelová, D., Hořínek, M., Pavlík, I. 2016a. Dynamika obyvatelstva v letech 2001-2015 a úroveň technické infrastruktury obcí střední části Moravského krasu s ohledem na rizika kontaminace povrchové vody komunálním odpadem. In: Sborník příspěvků z mezinárodní vědecké konference "Region v rozvoji společnosti 2016" (RESPO2016). Brno. p. 284-297. ISBN 978-80-7509-459-9
  40. Hübelová, D., Chalupa, P., Pavlík, I. 2017a Vzájemná propojenost přírodního a společenského prostředí jako motivace návštěvy Moravského krasu. StudiaTuristica. (8)1, 54-66.
  41. Hübelová, D., Chalupa, P., Pavlík, I. 2016a. Vybraná rizika znehodnocení krasového prostředí lidskou činností na příkladu CHKO Moravský kras. In: 11. mezinárodní konference Aktuální problémy cestovního ruchu. 24.-25. února 2016, Jihlava, Vysoká škola polytechnická. p. 126-138. ISBN 978-80-88064-21-3
  42. Hübelová, D., Konečný, O., Geršl, M., Pavlík, I. 2017b. Návštěvnost Moravského krasu v letech 2012-2015 v souvislosti s udržitelným rozvojem území a cestovního ruchu. In: Aktuální problémy cestovního ruchu "Cestovní ruch jako křižovatka poznatků". Jihlava: Vysoká škola polytechnická Jihlava. p. 104-114. ISBN 978-80-88064-30-5
  43. Hübelová, D., Modrá, H., Konečný, O., Geršl, M., Ulmann, V., Bartoš, M., Pavlík, I. 2017c. Možnosti hodnocení kontaminace vodního prostředí Amatérské jeskyně pesticidy a organickými látkami a zdravotní rizika. In: Sborník příspěvků z mezinárodní vědecké konference "Region v rozvoji společnosti 2017" (RESPO2017). 19. - 20. 10. 2017, Brno. p. 253-265. ISBN 978-80-7509-548-0
  44. Hubelova, D., Ulmann, V., Mikuska, P., Licbinsky, R., Alexa, L., Modra, H., Gersl, M., Babak, V., Weston, R. T., Pavlik, I. 2021. Nontuberculous mycobacteria prevalence in aerosol and spiders' webs in karst caves: Low risk for speleotherapy. Microorganisms. 9, 2573. Přejít k původnímu zdroji...
  45. Hurych, J., Štícha, R. 2020. Lékařská mikrobiologie Repetitorium. Praha: Stanislav Juhaňák - TRITON. 622 s. ISBN 978-80-7553-844-4
  46. Chaoqun, W., Yakov, K. 2024. Mechanisms and implications of bacterial-fungal competition for soil resources. The ISME Journal. 18(1), wrae073. Přejít k původnímu zdroji...
  47. IMDb. [2024]. Robert Koch, der Bekämpfer des Todes. In: IMDb. [cit. 2024-11-25]. https://www.imdb.com/title/tt0031868/?ref_=tt_mv_close
  48. Jurado, V., Laiz, L., Rodriguez-Nava, V., Boiron, P., Hermosin, B., Sanchez-Moral, S., Saiz-Jimenez, C. 2010. Pathogenic and opportunistic microorganisms in caves. International Journal of Speleology, 2010, 39 (1), 15-24. Přejít k původnímu zdroji...
  49. Justus, W., Valle, S., Barton, O. Gersham, A., Shannon, G. 2024. A review of bovine tuberculosis transmission risk in European wildlife communities. Mammal Review. 54, 325-340 Přejít k původnímu zdroji...
  50. Kaevska, M., Sterba, J., Svobodova, J., Pavlik, I. 2014. Mycobacterium avium subsp. avium and Mycobacterium neoaurum detection in an immunocompromised patient. Epidemiology and Infection. 142(4), 882-885. Přejít k původnímu zdroji...
  51. Kamath, P. L. 2022. Conserving rhinoceros in the face of disease. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119(25), e2206438119. Přejít k původnímu zdroji...
  52. Kaufmann, S.H. 2006. Envisioning future strategies for vaccination against tuberculosis. Nature Reviews. Immunology. 6(9), 699-704. Přejít k původnímu zdroji...
  53. Kaufmann, S. H. E. 2021. Vaccine development against tuberculosis over the last 140 years: Failure as part of success. Frontiers in Microbiology. 12, 750124. Přejít k původnímu zdroji...
  54. Kazda, J. 2000. The ecology of mycobacteria. Kluwer Acaademic Publishers. 72 s. ISBN 978-0-7923-6197-8 Přejít k původnímu zdroji...
  55. Kazda, J., Pavlik, I., Falkinham, J., Hruska, K. 2009. The ecology of mycobacteria: Impact on animal's and human's health. 1. vyd., Springer. 520 s. ISBN 978-1-4020-9412-5 Přejít k původnímu zdroji...
  56. Klanicova, B., Seda, J., Slana, I., Slany, M., Pavlik, I. 2013. The tracing of mycobacteria in drinking water supply systems by culture, conventional, and real time PCRs. Current Microbiology. 67, 725-731. Přejít k původnímu zdroji...
  57. Komínková, P., Koudelka, M., Novák, M. (ed.). 2022. Moravské Švýcarsko Jindřicha Wankla. Muzeum Blanenska, p.o. 391 s. ISBN 978-80-86951-43-0
  58. Kriz, P., Slana, I., Mrlik, V., Moravkova, M., Kralova, A., Krizova, K., Pavlik, I. 2010. Mycobacterium avium subsp. avium in domestic pigeons (Columba livia f. domestica) diagnosed by direct conventional multiplex PCR: A case report. Veterinarni Medicina. 55 (2), 87-90. Přejít k původnímu zdroji...
  59. Kriz, P., Parmova, I., Horackova, Z., Krupka, J., Feix, F., Slana, I., Kralova, A., Pavlik, I. 2014. Mycobacterium avium subsp. avium in lymph nodes and diaphragms of pigs from one infected herd in the Czech Republic. Journal of Food Protection. 77(1), 141-144. Přejít k původnímu zdroji...
  60. Krizova, K., Matlova, L., Horvathova, A., Moravkova, M., Beran, V., Boisselet, T., Babak, V., Slana, I., Pavlik, I. 2010. Mycobacteria in the environment of pig farms in the Czech Republic between 2003 and 2007. Veterinarni Medicina. 55 (2), 55-69. Přejít k původnímu zdroji...
  61. Křepela, K. 1995. Tuberkulóza dětí a dorostu a její diferenciální diagnostika. Praha: Nakladatelství MAXDORF - JESSENIUS. 223 s. ISBN 80-85912-03-1
  62. Lahey, T. 2003. Invasive Mycobacterium marinum infections. Emerging Infectious Diseases. 9(11), 1496-1498. Přejít k původnímu zdroji...
  63. Lehmann, K. B., Neumann, R. 1896. Atlas und Grundriss der Bakteriologie und Lehrbuch der speziellen bakteriologischen Diagnostik. 1. vyd. München: J. F. Lehmann. Přejít k původnímu zdroji...
  64. LPSN. 2024, LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature.
  65. Macek, P., Bodnarova, M., Zavada, J., Jezek, P., Pavlik, I., Slany, M., Havelkova, M., Stork, J., Duskova, J., Hanus, T., Kocvara, R. 2011. Mycobacterium marinum epididymoorchitis: Case report and literature review. Urologia Internationalis. 87(1), 120-124. Přejít k původnímu zdroji...
  66. Malá, J, Hrich, K, Vaculíková, K, Lejska, S. 2022. Multicriterial approach to the determination of buffer zones for the Moravian Karst protected landscape area in the Czech Republic. Environmental Monitoring and Assessment. 194(2), 103. Přejít k původnímu zdroji...
  67. Mátlová, L., Fischer, O., Kazda, J., Kaustová, J., Bartl, J., Horváthová, A., Pavlík, I. 1998. Výskyt mykobakterií u bezobratlých a poikilotermních živočichů a jejich význam při infekci zvířat a lidí. Veterinarni Medicina. 43 (4), 115-132.
  68. Matlova, L., Dvorska, L., Palecek, K., Maurenc, L., Bartos, M., Pavlik, I. 2004. Impact of sawdust and wood shavings in bedding on pig tuberculous lesions in lymph nodes, and IS1245 RFLP analysis of Mycobacterium avium subsp. hominissuis of serotypes 6 and 8 isolated from pigs and environment. Veterinary Microbiology. 102, 227-236. Přejít k původnímu zdroji...
  69. Mendes, I. V., Garcia, M. B., Bitencourt, A. C. A., Santana, R. H., Lins, P. C., Silveira, R., Simmons, B. A., Gladden, J. M., Kruger, R. H., Quirino, B. F. 2021. Bacterial diversity dynamics in microbial consortia selected for lignin utilization. PLoS One. 16(9), e0255083. Přejít k původnímu zdroji...
  70. Modra, H., Bartos, M., Hribova, P., Ulmann, V., Hubelova, D., Konecny, O., Gersl, M., Kudelka, J., Voros, D., Pavlik, I. 2017. Detection of mycobacteria in the environment of the Moravian Karst (Bull Rock Cave and the relevant water catchment area): The impact of water sediment, earthworm castings and bat guano. Veterinarni Medicina. 62, 153-168. Přejít k původnímu zdroji...
  71. Modrá, M., Gruberová, E., Konečný, O., Ulmann, V., Kaucká, P., Vlková, M., Tůma, A., Halešová, T., Kudělka, J., Geršl, M., Pavlík, I. 2018. Influx and concentration of triazine pesticides in the Amaterska cave system, Moravian Karst, Czech Republic. Journal of Soils and Sediments. 18(2), 640-647. Přejít k původnímu zdroji...
  72. Modra, H., Ulmann, V., Caha, J., Hubelova, D., Konecny, O., Svobodova, J., Weston, R. T., Pavlik, I. 2019. Socio-economic and environmental factors related to spatial differences in human non-tuberculous mycobacterial diseases in the Czech Republic. International Journal of Environmental Research and Public Health. 16, 3969. Přejít k původnímu zdroji...
  73. Modra, H., Ulmann, V., Gersl, M., Babak, V., Konecny, O., Hubelova, D., Caha, J., Kudelka, J., Falkinham, J. O. III., Pavlik, I. 2024. River sediments downstream of villages in a karstic watershed exhibited increased numbers and higher diversity of nontuberculous mycobacteria. Microbial Ecology. 87, 15. Přejít k původnímu zdroji...
  74. Moravkova, M., Lamka, J., Kriz, P., Pavlik, I. 2011. The presence of Mycobacterium avium subsp. avium in common pheasants (Phasianus colchicus) living in captivity and in other birds, vertebrates, non-vertebrates and the environment. Veterinarni Medicina. 56 (7), 333-343. Přejít k původnímu zdroji...
  75. Mrlik, V., Slany, M., Kubecka, Seda, J., Necas, A., Babak, V., Slana, I., Kriz, P., Pavlik, I. 2012. A low prevalence of mycobacteria in freshwater fish from water reservoirs, ponds and farms. Journal of Fish Diseases. 35, 497-504. Přejít k původnímu zdroji...
  76. Musil, R. 2019. Moravský kras. Průvodce Josefovským a Křtinským údolím. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita. 360 s. ISBN 978-80-210-8742-2
  77. TURBOSQUID BY SHUTTERSTOCK. 2024. 3D Models for Professionals: TurboSquid.
  78. Noma, K., Mizoguchi, Y., Tsumura, M., Okada, S. 2022. Mendelian susceptibility to mycobacterial diseases: State of the art. Clinical Microbiology and Infection. 28(11), 1429-1434. Přejít k původnímu zdroji...
  79. Nováková, A. 2008. Svět jeskyní pohledem mykologa. Živa. 2, 63-64.
  80. Nováková, A. 2017. Mikrobiota podzemních prostor. Živa. 5, 213-217.
  81. Nováková, A. 2022. Koprofilní houby v podzemí. Živa. 111-115.
  82. OIE. 2019. Bulletin Panorama. 2019-1. https://bulletin.woah.org/wp-content/uploads/bulletins/panorama-2019-1-en.pdf Přejít k původnímu zdroji...
  83. Pavlik, I. 2014a. Status of bovine tuberculosis control in countries of Central Europe and countries of the former Soviet Union. Kapitola 32. In: Thoen, C. O., Steele, J. H., Kaneene, J. B. (eds.). Zoonotic tuberculosis: Mycobacterium bovis and other pathogenic mycobacteria. 3. vyd. Wiley-Blackwell. p. 369-382. ISBN 978-1-118-47429-7 Přejít k původnímu zdroji...
  84. Pavlík, I. 2014b. Rozvoj zdravého regionu. Význam infekčních onemocnění lidí a zvířat a zoonóz při rozvoji regionů. 1. vyd. Mendelova univerzita v Brně. 208 s. ISBN 978-80-7509-033-1
  85. Pavlik, I. 2015. Na bovinní tuberkulózu není ještě možné zapomenout ani v České republice. Klinická mikrobiologie a infekční lékařství. 21 (2), 56-62.
  86. Pavlík, I. 2016. Rekreace u vody nemusí být vždy bezpečná: zdravotní rizika kontaminace povrchových vod různými původci onemocnění. In: Sborník příspěvků z mezinárodní vědecké konference "Region v rozvoji společnosti 2016" (RESPO2016). Brno, 2016. s. 731-740, ISBN 978-80-7509-459-9
  87. Pavlík, I., Garmendia, M. Á. Z. 2022. Wild birds and mammals in nicaragua and its regional development. Part 3. 1. vyd. Mendelova univerzita v Brně. 440 s. ISBN 978-80-7509-876-4 (print), ISBN 978-80-7509-877-1 (online; pdf), https://doi.org/10.11118/978-80-7509-877-1 Přejít k původnímu zdroji...
  88. Pavlík, I., Hübelová, D. 2014. Rizika rozvoje regionu. Význam onemocnění lidí a zvířat v rozvinutém regionu. 1. vyd. Mendelova univerzita v Brně. 96 s. ISBN 978-80-7509-370-7
  89. Pavlik, I., Gersl, M., Bartos, M., Ulmann, V., Kaucka, P., Caha, J., Unc, A., Hubelova, D., Konecny, O., Modra, H. 2018. Nontuberculous mycobacteria in the environment of Hranice Abyss, the world's deepest flooded cave (Hranice Karst, Czech Republic). Environmental Science and Pollution Research. 25(24), 23712-23724. Přejít k původnímu zdroji...
  90. Pavlík, I., Hübelová, D., Konečný, O. 2017. Příspěvek ke geografii zdraví: zdroje kontaminace povrchové vody a zdravotní rizika v CHKO Moravský kras. Geographia Cassoviensis. XI(1), 33-50.
  91. Pavlík, I., Hübelová, D., Horák, M., Somerlíková, K. 2015. Význam onemocnění lidí a zvířat pro rozvoj regionů. 1. vyd. 165 s. Mendelova univerzita v Brně. ISBN 978-80-7509-372-1 Přejít k původnímu zdroji...
  92. Pavlik, I., Jahn, P., Moravkova, M., Matlova, L., Treml, F., Cizek, A., Nesnalova, E., Dvorska-Bartosova, L., Halouzka, R. 2008. Lung tuberculosis in a horse caused by Mycobacterium avium subsp. avium of seroype 2: A case report. Veterinarni Medicina. 53(2), 111-116. Přejít k původnímu zdroji...
  93. Pavlík, I., Pavlas, M., Bejčková, L. 1994. Výskyt, ekonomický význam a diagnostika paratuberkulózy. Veterinarni Medicina. 39(8), 451-496.
  94. Pavlik, I., Ulmann, V., Weston, R.T. 2021a. Clinical relevance and environmental prevalence of Mycobacterium fortuitum group members: Comment on Mugetti et al. Gene sequencing and phylogenetic analysis: Powerful tools for an improved diagnosis of fish mycobacteriosis caused by Mycobacterium fortuitum group members. Microorganism. 9(11), 2345. Přejít k původnímu zdroji...
  95. Pavlik, I., Ulmann, V., Falkinham, J. O. III. 2022a. Nontuberculous mycobacteria: Ecology and impact on animal and human health. Microorganisms. 10(8), 1516. Přejít k původnímu zdroji...
  96. Pavlik, I., Ulmann, V., Hubelova, D., Weston, R. T. 2022b. Nontuberculous mycobacteria as sapronoses: A review. Microorganisms. 10, 1345. Přejít k původnímu zdroji...
  97. Pavlik, I., Ulmann, V., Modra, H., Gersl, M., Rantova, B., Zukal, J., Zukalova, K., Konecny, O., Kana, V., Kubalek, P., Babak, V., Weston, R. T. 2021b. Nontuberculous mycobacteria prevalence in bats' guano from caves and attics of buildings studied by culture and qPCR examinations. Microorganisms. 9, 2236. Přejít k původnímu zdroji...
  98. Ramírez-Fráncel, L. A., García-Herrera, L. V., Losada-Prado, S., Reinoso-Flórez, G., Sánchez-Hernández, A., Estrada-Villegas, S., Lim, B. K., Guevara, G. 2022. Bats and their vital ecosystem services: A global review. Integrative Zoology. 17(1), 2-23. Přejít k původnímu zdroji...
  99. Rito, T., Inlamea, O., Oliveira, P., Duarte, R., Soares, P., Correia-Neves, M. 2023. Evolution and Molecular Characteristics of Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium bovis. In: Rezaei, N. (ed.). Tuberculosis. Integrated Science, kapitola 11. Springer, Cham. p. 847-865. ISBN 978-3031159541. https://doi.org/10.1007/978-3-031-15955-8_41 Přejít k původnímu zdroji...
  100. Rusterholtz, K. J., Mallory, L. M. 1994. Density, activity, and diversity of bacteria indigenous to a karstic aquifer. Microbial Ecology. 28(1), 79-99. Přejít k původnímu zdroji...
  101. Ryskova, L., Bolehovska, R., Kukla, R., Svarc, M., Zavrelova, A., Vanicek, H., Pavlik, I., Bostik, P. 2022a. Mycobacterioses induced by Mycobacterium abscessus: Case studies indicating the importance of molecular analysis for the identification of antibiotic resistance. Antibiotics-Basel. 11(7), 873. Přejít k původnímu zdroji...
  102. Ryskova, L., Kukla, R., Bolehovska, R., Prokes, L., Vajda, M., Kucera, T., Pavlik, I., Bostik, P., Ryska, P. 2023. A rare case of osteomyelitis of an ankle caused by Mycobacterium chelonae. Antibiotics-Basel. 12, 97. Přejít k původnímu zdroji...
  103. Ryskova, L., Zahradnicek, J., Kukla, R., Bolehovska, R., Vajda, M., Pavlik, I., Bostik, P., Ryska, P. 2022b Dual infection of an open fracture caused by Mycobacterium setense and Clostridium celerecrescens. Antibiotics-Basel. 11, 1254. Přejít k původnímu zdroji...
  104. Shitaye, J. E., Halouzka, R., Svobodova, J., Grymova, V., Grym, M., Skoric, M., Fictum, P., Beran, V., Slany, M., Pavlik, I. 2010. First isolation of Mycobacterium genavense in blue headed parrot (Pionus menstruus) imported from Surinam (South America) to the Czech Republic: A case report. Veterinarni Medicina. 55(7), 339-347. Přejít k původnímu zdroji...
  105. Shitaye, J. E., Matlova, L., Horvathova, A., Moravkova, M., Dvorska-Bartosova, L., Treml, F., Lamka, J., Pavlik, I. 2008a. Mycobacterium avium subsp. avium distribution studied in a naturally infected hen flock and in the environment by culture, serotyping and IS901 RFLP methods. Veterinary Microbiology. 127, 155-164. Přejít k původnímu zdroji...
  106. Shitaye, J. E., Matlova, L., Horvathova, A., Moravkova, M., Dvorska-Bartosova, L., Trcka, I., Lamka, J., Treml, F., Vrbas, V., Pavlik, I. 2008b. Diagnostic testing of different stages of avian tuberculosis in naturally infected hens (Gallus domesticus) by the tuberculin skin agglutination tests, faecal and egg examinations. Veterinarni Medicina. 53 (2), 101-110. Přejít k původnímu zdroji...
  107. Shitaye, J. E., Horvathova, A., Bartosova, L., Moravkova, M., Kaevska, M., Donnelly, N., Pavlik, I. 2009. Distribution of non-tuberculosis mycobacteria in the environmental samples from slaughterhouse and in raw and processed meats. Czech Journal of Food Sciences, 27(3), 194-202. Přejít k původnímu zdroji...
  108. Skoric, M., Fictum, P., Frgelecova, L., Kriz, P., Slana, I., Kaevska, M., Pavlik, I. 2010. Avian tuberculosis in a captured Ruppell's griffon vulture (Gyps ruppellii). Veterinarni Medicina. 55(7), 348-352. Přejít k původnímu zdroji...
  109. Skoric, M., Mrlik, V., Svobodova, J., Beran, V., Slany, M., Fictum, P., Pokorny, J., Pavlik, I. 2012. Infection in a Komodo dragon (Varanus komodoensis) caused by Mycobacterium intracellulare: A case report. Veterinarni Medicina, 57(3), 163-168. Přejít k původnímu zdroji...
  110. Skoric, M., Shitaye, J. E., Halouzka, R., Fictum, P., Trcka, I., Heroldova, M., Tkadlec, E., Pavlik, I. 2007. Tuberculous and tuberculoid lesions in free living small terrestrial mammals and the risk of infection to humans and animals: A review. Veterinarni Medicina. 52(4), 144-161. Přejít k původnímu zdroji...
  111. Slany, M., Knotek, Z., Skoric, M., Knotkova, Z., Svobodova, J., Mrlik, V., Moravkova, M., Pavlik, I. 2010a. Systemic mixed infection in a brown caiman (Caiman crocodilus fuscus) caused by Mycobacterium szulgai and M. chelonae: A case report. Veterinarni Medicina, 55 (2), 91-96. Přejít k původnímu zdroji...
  112. Slany, M., Svobodova, J., Ettlova, A., Slana, I., Mrlik, V., Pavlik, I. 2010b. Mycobacterium arupense among the isolates of non-tuberculous mycobacteria from human, animal and environmental samples. Veterinarni Medicina, 55 (8), 369-376. Přejít k původnímu zdroji...
  113. Slany, M., Jezek, P., Fiserova, V., Bodnarova, M., Stork, J., Havelkova, M., Kalat, F., Pavlik, I. 2012. Mycobacterium marinum infections in humans and tracing of its possible environmental sources. Canadian Journal of Microbiology. 58, 1-6. Přejít k původnímu zdroji...
  114. Slany, M., Makovcova, J., Jezek, P., Bodnarova, M., Pavlik, I. 2014. Relative prevalence of Mycobacterium marinum in fish collected from aquaria and natural freshwaters in central Europe. Journal of Fish Disease. 37(6), 527-533. Přejít k původnímu zdroji...
  115. Supply, P., Brosch, R. 2017. The Biology and epidemiology of Mycobacterium canettii. Kapitola 2. In: Gagneux , S. (ed.). Strain variation in the Mycobacterium tuberculosis complex: Its role in biology, epidemiology and control. Advances in Experimental Medicine and Biology. 1019, 27-41. Přejít k původnímu zdroji...
  116. Sýkora, M., Šustr, M. 2018. Moravské Švýcarsko na starých pohlednicích. 1. vyd. Tváře. 140 s. ISBN 978-80-906621-8-6
  117. Školoudík, L., Chrobok, V., Ryšková, L., Dědková, J., Laco, J., Vaníček, H. 2018. Netuberkulózní mykobakteriální krční lymfnoditida v dětském věku. Pediatrie pro praxi. 19(5), 244-247. Přejít k původnímu zdroji...
  118. Thoen, C. O., Steele, J. H., Gilsdorf, M. J. 2006. Mycobacterium bovis infection in animals and humans. 2. vyd. Blackwell Publishing Professional, Ames, Iowa, USA. 317 s. ISBN-13: 978-0-8138-0919-9
  119. Tobin, D. M., Ramakrishnan, L. 2008. Comparative pathogenesis of Mycobacterium marinum and Mycobacterium tuberculosis. Cellular Microbiology. 10(5), 1027-1039. Přejít k původnímu zdroji...
  120. Trebichavský, I. 2014. Nejstarší stopy života. Živa. 1, I-II.
  121. Ulmann, V., Kozel, R., Tudík, I., Pavlík, I. 2023. Mykobakteriózy - nejčastější původci. Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie. 72(3), 151-163.
  122. Ulmann, V., Modra, H., Babak, V., Weston, R. T., Pavlik, I. 2021. Recovery of mycobacteria from heavily contaminated environmental matrices. Microorganisms. 9, 2178. Přejít k původnímu zdroji...
  123. Ulmann, V., Kracalikova, A., Dziedzinska, R. 2015. Mycobacteria in water used for personal hygiene in heavy industry and collieries: A potential risk for employees. International Journal of Environmental Research and Public Health. 12, 2870-2877. Přejít k původnímu zdroji...
  124. Ulmann, V., Modra, H., Babak, V., Weston, R. T., Pavlik, I. 2021. Recovery of mycobacteria from heavily contaminated environmental matrices. Microorganisms. 9, 2178. Přejít k původnímu zdroji...
  125. Ulmann, V., Modrá, H., Bartoš, M., Caha, J., Hübelová, D., Konečný, O., Pavlík, I. 2018. Epidemiologie vybraných zástupců komplexu Mycobacterium tuberculosis v České republice v letech 2000-2016. Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie. 67(4), 184-190.
  126. ÚZIS. 2022. Základní přehled epidemiologické sutiace ve výskytu tuberkulózy v České republice v roce 2021. In: UZIS. www.uzis.cz
  127. van der Zanden, R. J., Magis-Escurra, C., de Lange, W. C., Hoefsloot, W., Boeree, M. J., van Ingen, J., van Soolingen, D. 2012. Hypersensitivity pneumonitis caused by Mycobacterium avium subsp. hominissuis in a hot tub, as proven by IS1245 RFLP and rep-PCR typing. International Journal of Mycobacteriology. 1(3), 152-154. Přejít k původnímu zdroji...
  128. Wallenfels, J., Vašáková, M., Solovič, I. 2018. Aktuální farmakoterapie tuberkulozy. Klinická farmakologie a farmacie. 32(4), 10-14. Přejít k původnímu zdroji...
  129. Wang, Y., Ogawa, M., Fukuda, K., Miyamoto, H., Taniguchi, H. 2006. Isolation and identification of mycobacteria from soils at an illegal dumping site and landfills in Japan. Microbiology and Immunoly. 50, 513-524. Přejít k původnímu zdroji...
  130. Wankel, J. 1984. Obrazy z Moravského Švýcarska a jeho minulosti. Originální název: Bilder aus der Mährischen Schweiz und ihrer Vergangenheit, 1882 (překlad Grolich, V., Svoboda, O., Urban, J.), Muzejní a vlastivědná společnost (Brno), Okresní muzeum (Blansko). 306 s.
  131. Whipple, M. J., Rohovec, J. S. 1994. The effect of heat and low Ph on selected viral and bacterial fish pathogens. Aquaculture. 123, 179-189. Přejít k původnímu zdroji...
  132. WHO. 2022. 2.1 Case notifications (who.int).WHO. 2023. Tuberculosis. Privacy Legal Notice. [Citace: 25. březen 2023.] https://www.who.int/teams/global-tuberculosis-programme/overview
  133. WHO. 2024. Leprosy. Leprosy (who.int).
  134. Zajíček, P. 2017. Moravský kras v ponorné řece času. Praha: Academia. 279 s. ISBN 978-80-200-2723-8
  135. Zajíček, P., Oliva, M., Kostrhun, P. 2021. Karel Absolon: Objevitel, manažer, vědec. 1. vyd. Praha: Academia. 431 s. ISBN 978-80-200-3167-9
  136. Zinsstag, J., Borna, M., Pavlik, I. 2011. Mycobacterioses. Kapitola 15. In: Palmer, S. R., Soulsby, L., Torgerson, P. R., Brown, D. W. G. (eds.). Oxford Textbook of Zoonoses. Biology, Clinical Practice and Public Health Control. 2. vyd. Oxford University Press. s. 128-135. ISBN 978-0-19-857002-8 Přejít k původnímu zdroji...
  137. Zukalova, K., Seidlova, V., Ulmann, V., Pavlik, I., Pikula, J., Zukal, J. 2023. Prevalence of non-tuberculous mycobacteria in Noctule (Nyctalus noctula) females during gestation. Acta Chiropterologica. 25(2), 351-361. Přejít k původnímu zdroji...